Развернувшись за несколько минут до взрыва, вызванного основной командой F.E.A.R., вы берете на себя роль специального оперативника Майкла Беккета во время вашей самой обычной миссии, постепенно превращающейся в борьбу за выживание против гнева Альмы. После того, как страшная сила Альмы вышла из-под контроля, ваш отряд вынужден прорываться через апокалиптические дебри в поисках зацепок о том, как уничтожить её.